检查牙齿的形态、排列、缺损状况、活动度、色泽及存在的黏附斑、软垢（死菌、食物碎屑、脱落的鳞状上皮细胞构成）和牙结石。
用压舌板或口镜柄轻轻敲击牙齿以检测叩痛（叩诊敏感度）。叩痛提示深龋（蛀牙）引起的牙髓坏死伴根尖周炎或严重的牙周疾病。叩痛或咬拇疼痛也可能是牙齿不完全折裂。接近上颌窦的多个牙齿叩诊疼痛可能由于上颌窦炎引起。牙齿根尖部压痛提示脓肿形成。
多个牙齿松动通常提示严重的牙周病，但也可由夜磨牙症（咬紧或研磨牙齿）或创伤损伤牙周组织所引起。 少见的情况下，肿瘤侵蚀牙槽骨（如成釉质细胞瘤、嗜酸性肉芽肿）导致牙齿松动。 如果多个牙齿松动而没有明显的色素沉着和牙结石应考虑为肿瘤或全身性疾病导致的牙槽骨吸收（如糖尿病、甲状旁腺功能亢进、骨质疏松症、库欣综合征）。
牙结石是矿化的菌斑－由细菌、食物残渣、唾液蛋白、含钙和磷酸盐的黏液所构成的沉结物。洁牙后，含黏多糖的薄膜很快沉积于牙面。 24小时后，细菌聚集使黏多糖薄膜转化成菌斑。 72小时后，斑块开始钙化，成为结石。若出现牙结石，其最多见沉积于接近下颌下腺和舌下腺导管开口处的下前牙舌侧面，腮腺导管开口处的上颌磨牙的颊侧面。
由于脱矿质，龋齿（蛀牙）首先表现为牙釉质中的白点/缺陷。 龋齿进展导致空洞的棕色病变。白斑的再矿化通常采用氟化物或磷酸钙化合物来修复牙釉质缺损。
牙齿磨损可能因严重胃食管反流 （侵蚀）胃酸暴露，磨牙症 的机械作用（磨损）或在相对面的釉上摩擦瓷冠（瓷比瓷釉坚硬）或老龄化所致。磨损使咀嚼效率下降，当磨损使釉质下的牙本质暴露时引起非龋性牙齿疼痛。牙本质对接触和温度变化敏感。牙医可以使这些牙齿不敏感，或者通过将牙冠或嵌体覆盖在严重磨损的牙齿上来恢复牙齿解剖结构。比较轻的牙根部敏感的病例，暴露的牙根面可以通过涂擦氟化物或硝酸钾或牙本质黏结剂而脱敏。
牙齿畸形 意味着可能存在发育性或内分泌疾病。在唐氏综合症，牙齿较小，有时合并侧切牙或前磨牙发育不全和圆锥形下颌切牙。先天性梅毒者，切牙的切端1/3收缩，形成螺钉或锥状外形，切端的中央有凹陷（哈钦森切牙）；第一磨牙变小，拇面明显缩小，釉质粗糙、呈分叶状伴发育不全（桑葚状磨牙）。外胚层发育不全症时，牙齿缺失或呈锥形，可能需从小戴义齿。
牙本质发育不全症是一种染色体显性遗传 疾病，形成暗棕色的乳光牙本质，强度不足以支持其上覆盖的釉质，因此，这种牙齿无法承受咬拇力量而迅速磨损。因此，这种牙齿无法承受咬拇力量而迅速磨损。
患有 生长激素缺乏 或患有先天性 甲状旁腺功能低下 牙根较小； 巨人症 有大根。肢端肥大症引起牙根中的牙骨质增生以及颌骨肥大，因此牙齿之间的间隙变大。肢端肥大症也可引起开合，这种情况发生在咬合时上下颌切牙无法接触。
先天性窄侧切牙可发生于健康的人。先天性缺牙好发牙位为第三磨牙，其次为上颌侧切牙和下颌第二磨牙。
牙齿色泽的缺陷必须与食物色素沉着、增龄性变化和最主要的吸烟引起的变暗或泛黄相鉴别。 因为牙髓坏死牙齿可呈灰色，通常是由大量龋洞穿通牙髓，或牙外伤后含铁血黄素沉积于牙本质所致，伴或不伴牙髓坏死。
儿童牙齿的永久性变暗，往往由于母亲怀孕的后半阶段或牙形成（发育）期间、尤其是持续至9岁的牙冠钙化期服用四环素的缘故，即使短期使用四环素也会引起牙齿变色。四环素极少引起完全形成的成人牙齿的永久性变色。米诺环素能使骨组织色泽加深，如果牙槽骨表面覆盖的牙龈或黏膜菲薄时，口腔内可见到这种现象。在特定的紫外光照射下，四环素牙发出独特的荧光。
先天性卟啉病，乳牙和恒牙都可能带有红色或棕色，但是色素沉着牙本质的荧光总呈现红色。先天性高胆红素血症引起牙齿变黄。
变色的牙齿能够被漂白（见表牙齿美白程序)
表格牙齿美白程序表格 牙齿美白程序
牙齿美白程序操作者
制剂成分
注释
口腔科医生
在诊所
高浓度过氧化氢涂于牙表面，然后可见光或激光照射
非常有效，必须保护牙龈、皮
肤和眼睛
患者
在家
将10％过氧化脲（使用时调配成3.5％过氧化氢）和一种增稠剂加入个体化托盘
非常有效，必须保护牙龈、皮
患者（OTC产品）
商用漂白条
由过氧化脲组成
非常有效，必须保护牙龈、皮
增白牙膏
通常含脲或过氧化氢
有一定效果
增白涂剂
通常由二氧化钛构成
效果较差
牙釉质缺损可以由佝偻病引起，导致釉质表面产生粗糙、不规则的条带。在牙齿发育过程中任何持续性发热性疾病都可能导致再牙釉质上出现永久狭窄的垩白区域，或仅在牙齿萌出后可见釉质变白。因此，疾病发生的年龄和持续时间可以从条纹的位置和高度进行估计。
牙釉质点蚀也发生于结节性硬化症和安格尔曼综合症。牙釉质形成不全是一种 染色体显性遗传疾病，引起严重的釉质发育不良。慢性呕吐和胃食管反流可能使牙冠脱钙，主要发生于上前牙的舌侧。
长期吸食可卡因者可能引起牙齿广泛脱钙，因为药物在唾液中解离为一种碱和盐酸。长期吸食甲基苯丙胺引起口干病、严重龋齿和牙周炎症（“冰毒嘴”）。
花很多时间在含氯水池中的游泳者，牙齿外表面（唇颊侧），尤其是上颌切牙、尖牙和第一前磨牙的外表面易丢失牙釉质。 如果在水池中加入碳酸钠调整pH值，牙面上就会形成棕色的牙结石，这种牙结石可通过牙洁治去除。
氟中毒 是指在牙齿发育阶段，喝含氟量>1.5ppm的饮用水的儿童可能引起釉质斑纹。 氟中毒取决于氟的摄入量和儿童暴露的年龄。釉质的变化范围从不规则的白色不透明区域到整个牙冠呈现粗糙的深棕色改变，这类牙齿对龋坏具有很强的抵抗力。